McAfee har vært svært kritisk til Microsoft, og selv publiserte en helsides avisannonser McAfee angripe Microsoft. Men nylig administrerende direktør av McAfees sikkerhetsarkitektur og regissør John Viega sier de jobber med Microsoft for å utvikle nye operativsystem Vista for sikkerheten av programvare-plattform, og har sagt det, tenker han har de fortsatt å være forsiktig.
"Microsoft sa at de ville samarbeide med sikkerhetsleverandørene, åpne API, slik at vi kan bruke vår beste teknologi for å opprettholde sikkerheten for deres plattform." Har nektet å gi kjernen koden for Microsofts mange sikkerhetsleverandørene rasende, nå Viega to forskjeller mellom selskapet ikke lenger har sterke meninger som før: «Vi er faktisk i god tro samarbeid, har vi og Microsoft hadde en lang historie med å arbeide sammen, er den ulykkelige fortiden bare en liten ting."
For ikke lenge siden Microsoft co-president Jim Allchin i sin blogg satte retorikk: "Vista krever ikke ekstra anti-virus-programvare!" En sensasjon etter at han forklarte betydningen av det er fordi han var feiltolket, ment ikke så Han sa at for Vista, i mange tilfeller anti-virus programvare er nødvendig.